
<html>

<body>

<br>

Jueves 19 de diciembre <b>12 hs</b>. en el aula de seminarios<br><br>

<br><br>

Dr. Ignacio Schor Furlong lab Genome Biology Unit – EMBL Heidelberg

<br><br>

<br>

Tratando de entender la complejidad transcripcional a escala genómica

durante el desarrollo embrionario de Drosophila <br><br>

Para entender a nivel molecular el desarrollo embrionario en los metazoos

es necesario comprender el funcionamiento de las redes genéticas que lo

dirigen. Clásicamente, se consideran que los actores principales en

dichas redes son factores de transcripción regulatorios

tejido-específicos y las secuencias del DNA a las cuales se unen

(enhancers y silencers). Si bien este rol central se mantiene en la

visión actual, investigaciones posteriores incluyeron otros niveles de

regulación, como ser regulación post-transcripcional, cambios en la

cromatina y acción de miRNAs. Mi trabajo actual consiste en el estudio a

escala genómica de otros aspectos novedosos de la regulación de la

expresión génica: los diferentes tipos de promotores, la acción de los

RNA no codificantes largos (lncRNAs) y la transcripción de los enhancers

(eRNAs). El laboratorio Furlong ha estudiado por años los mecanismos

moleculares que regulan el desarrollo embrionario in vivo. Para eso se

utiliza como sistema modelo el desarrollo del mesodermo en la mosca

Drosophila melanogaster. Fruto del trabajo del grupo, disponemos de una

gran cantidad de datos en diferentes estadios en este tejido, tales como

sitios de unión de los factores de transcripción claves, actividad de

enhancers, marcas de cromatina, etc. Si bien es un trabajo en progreso,

presentaré en principio los sets de datos que generamos para este

propósito, que incluyen bibliotecas de sitios de inicio de transcripción

en diferentes estadios para decenas de líneas de moscas (de forma de

poder realizar un estudio de asociación a escala genómica) y bibliotecas

de RNAseq direccional a partir de RNA total de células de mesodermo

depletado de rRNA. Finalmente, a partir de nuestros análisis

preliminares, voy a contar las nuevas preguntas que podemos hacernos y

los esfuerzos que estamos realizando para integrar estos datos. <br><br>

Host: ARK </body>

</html>