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Seminario <b>jueves 7</b> de mayo, <b>13 hs</b>. Aula de seminarios del
LFBM<br><br>
Description Dra. Verónica Becher <br><br>
Título : Repeticiones perfectas en el genoma humano, un cómputo
exhaustive pero eficiente<br><br>
Se sabe bien que el 95% del genoma de las especies eucariotas consiste de
secuencias no codificantes, en su mayor parte repetitivas. El problema es
encontrarlas, caracterizarlas y comprender su función. Ya se avanzó mucho
en identificarlas en el genoma humano, y en los de otras especies. Sin
embargo, falta un análisis cuantitativo exhaustivo. La dificultad es que
las repeticiones tienen largo arbitrario, y pueden estar
arbitrariamente distantes. Y los genomas son muy muy grandes.<br><br>
Con el grupo Kapow desarrollamos un nuevo algoritmo, particularmente
eficiente, para <br>
computar todas las repeticiones perfectas en secuencias de hasta 500
millones de nucleótidos. Esto permite incluir uno o más cromosmomas
enteros conjuntamente.<br><br>
En esta charla contaré el experimento que hicimos con el genoma humano:
Computamos todas las repeticiones perfectas de longitud mayor que 40
bases, tanto las que ocurren en un cromosoma individual como las que
ocurren conjuntamente en <br>
dos cromosomas. Dimos estadísticas de cantidad, diversidad y frecuencia,
mostramos como las repeticiones están distribuidas en los cromosomas, las
identificamos biológicamente, y encontramos repeticiones que
actualmente no figuran en las bases de datos disponibles. Y para mostrar
los resultados hicimos dibujos con lindos colores. Los mostraré y estaré
encantada de que hagan muchas preguntas.<br><br>
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Host: Francisco Urbano/ Alberto Kornblihtt </body>
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