[Todos] Fwd: charla miercoles 23/07 a las 11, Aula Seminario Fisica

[Silvina Ponce Dawson]

Les recuerdo la charla de maniana a las 11.
Saludos
Silvina

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From: Silvina Ponce Dawson <silvina en df.uba.ar>
Date: 2014-07-19 14:40 GMT-03:00
Subject: charla miercoles 23/07 a las 11, Aula Seminario Fisica
To: depfis <depfis en df.uba.ar>
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Charla
Miercoles 23/07 a las 11, Aula de Seminarios, Dto Fisica, segundo piso, Pab
I

Reconstruccion de arboles filogeneticos a traves de redes metabolicas

Daniel Gamermann
Instituto de Física
Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)

Ciencias que tradicionalmente adoptaban un paradigma más cualitativo cada
vez más están utilizando metodologías numéricas en sus análisis. Un claro
ejemplo de esa situación aparece en la biotecnología y en el estudio de la
genética, dos ramas de la biología. Muchos de los sistemas que se estudian
en la biología forman redes interconectadas de sus partes y la aplicación
de la teoría de grafos a estos sistemas viene naturalmente. Nosotros
estudiamos redes metabólicas de organismos y en ese trabajo nos gustaría
evaluar la aplicación de una metodología basada en la teoría de grafos para
la reconstrucción de árboles filogenéticos. �rboles filogenéticos son una
forma de representar visualmente la distancia evolutiva de diferentes
organismos.  Actualmente esos árboles son inferidos con base en
alineamientos de secuencias de genes homólogos entre diferentes especies.
Nosotros aplicamos conceptos de la teoría de grafos para definir una
distancia entre dos redes y utilizando el algoritmo de Kruskal construimos
un dendrograma que representa el árbol evolutivo de un conjunto de
organismos. Esos árboles, generados con base en las redes metabólicas, son
comparados con árboles generadas por medio de alineamiento de genes y
proteínas y las diferencias son sistemáticamente evaluadas utilizándose la
métrica de Robinson-Foulds.


Miercoles 23/07 a las 11, Aula de Seminarios, Dto Fisica, segundo piso, Pab
I



2014-07-13 22:01 GMT-03:00 Claudia Sepúlveda <claudia en qb.fcen.uba.ar>:

> SEMINARIOS DEL DEPARTAMENTO DE QU�MICA BIOLÓGICA
>
> Lamentamos informarles que el seminario del próximo lunes 14 de julio
> queda cancelado. Retomaremos con los encuentros el lunes 04 de agosto,
> después del receso invernal.
> Saludos.
>
> Martín Edreira
> Diego Grinman
> Diego Laderach
> Claudia Sepúlveda
>
> Organizadores de los Seminarios del Dpto Química Biológica, FCEN-UBA.
>
>
> Puede consultarse la agenda de próximos seminarios en
> http://www.qb.fcen.uba.ar/seminarios.html
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-- 
Silvina Ponce Dawson
Depto Fisica e IFIBA-CONICET
FCEN-UBA
Ciudad Universitaria, Pab I
(1428) Buenos Aires, Argentina
Phone: (5411) 4576 3353
Fax: (5411) 4576 3357



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