[Todos] Seminario del Departamento de Química Biológica
Maria de Carmen Vila
mvila en qb.fcen.uba.ar
Mie Abr 25 13:45:58 ART 2007
Lunes 30 de abril:
Seminario del Departamento de Química Biológica
Título: Dinámica de hormonas neuroendócrinas en medio fisiológico.
Simulación mediante dinamica molecular
Expositor: Dra María Cristina Donnamaria
Investigador Independiente de la CIC
Instituto de Fisica de Liquidos y Sistemas Biologicos, IFLYSIB
Resumen del Seminario:Entre las técnicas de modelización biomolecular, la
simulación mediante dinámica molecular (DM) ha probado ser una eficaz
herramienta de predicción de propiedades en variados sistemas
biomoleculares. En el presente trabajo, utilizando DM, se estudian
propiedades dinámicas y de hidratación en soluciones acuosas y fisiológicas
del Exendin-4 (EX4), veneno originariamente aislado de la saliva del
lagarto de Gila, y del Glucagon like peptide-1 (GLP-1) hormona segregada en
el intestino de mamíferos. El interés en estas pequeñas hormonas
neuroendocrinas de 39 y 30 aminoácidos, radica en la importancia de su
acción glucoreguladora, siendo potenciales agentes terapéuticos en el
control de diabetes y obesidad. El Ex4, comparte el 53 % de homologia con
el GLP-1, respecto del que presenta un tiempo medio de vida mayor en
mamíferos, y por tanto, una más efectiva acción farmacológica. Las
simulaciones de DM se realizan con el paquete, GROMOS 96, a temperatura y
presión constantes y en condiciones normales (P= 1 bar, T= 300K), durante
3ns, en soluciones acuosas y fisiológicas. En solución acuosa se trabaja
con moléculas de agua SPC/E. Para el estudio en solución fisiólogica se
emplean dos metodologias para simular las condiciones del medio, a)
utilizando campo de reacción y b) incluyendo contraiones en condiciones
fisiológicas de densidad. A partir de los resultados de DM se analizaron
las preferencias conformacionales y de movilidad de ambos biopéptidos. Los
resultados brindan información sobre estructuras promedios, desviaciones
cuadraticas medias (RMS) de los C-a , respecto de las conformaciones
iniciales y analisis de estadística de puentes H internos. El presente
estudio aporta además datos en la comparación de metodologías para el
tratamiento de biomoléculas en solucion fisiológica.
Los esperamos el lunes a las 13.30 hs en el Aula del Departamento.
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